Cuando la diabólica organización Akatsuki pone en marcha su plan para obtener los poderes chakra de Jinchukiri como Naruto, el único plan que pueden seguir los buenos es lo que mejor saben hacer: contraatacar.
Naruto Shippuden Ninja Council 3 European Version te pondrá en la piel de Naruto y compañía mientras avanzas en una historia basada en los primeros 30 episodios de la serie Naruto Shippuden. Escoge entre Naruto, Sakura, Neji, Rock Lee y Kakashi y préparate para luchar en niveles de desplazamiento lateral llenos de hábiles enemigos y jefes peligrosos.
La mayoría de niveles te dará la opción de escoger dos personajes de apoyo para ayudarte en la lucha, permitiéndote intercambiar luchadores con un toque en tu pantalla táctil. Cada luchador de tu cuadrilla cuenta con sus propios movimientos especiales, que se activan realizando tareas específicas en la pantalla táctil. Realiza el movimiento adecuado con tu lápiz en rápidos minijuegos para activar ataques espectaculares y consigue nuevos movimientos para tus personajes ganando tantos puntos como te sea posible en cada escena.