Año 1190 d.C., época de la Tercera Cruzada. Los cristianos intentan recuperar Tierra Santa, en manos de los sarracenos, conquistando así la Ciudad Santa de Jerusalén.
Un joven asesino llamado Altaïr deberá encontrar y recuperar un objeto sagrado: el Santo Grial. Se dice que tiene el poder de unir bajo una sola bandera a todas las facciones bajo el control de quien lo posee y poner fin a la Tercera Cruzada obteniendo la victoria o bien de los cruzados o de los sarracenos. Por lo tanto, el Cáliz, al ser un objeto tan poderoso en manos de los hombres, ha de ser encontrado y destruido.
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